Моран Яссур

Моран Ясур

Научный деятель

Дата рождения

22 апреля 1979 года

Известна как

специалист в области вычислительной биологии и исследования микробиома

учёный

Моран Яссур (англ. Moran Yassour, ивр. מורן יסעור) — израильский учёный, специалист по вычислительной биологии из Еврейского университета в Иерусалиме.

Биография

Родилась 22 апреля 1979 года.

С отличием завершила обучение в бакалавриате и магистратуре по специальности «Информатика и вычислительная биология» в Еврейском университете в Иерусалиме, получила докторскую степень по информатике в Еврейском университете в Иерусалиме под совместным руководством Нира Фридмана и Авива Регева. Ее докторская диссертация была посвящена разработке вычислительных подходов к реконструкции и анализу транскриптома, что привело к созданию Trinity, инструмента для сборки данных РНК-секвенирования, опубликованного в журнале Nature Biotechnology в 2011 году. В исследовании представлена ​​вычислительная модель, позволяющая точно реконструировать полноразмерные экспрессируемые гены без необходимости знать геномную последовательность данного организма (например, для животных, не являющихся модельными животными, или в случаях, когда геном значительно изменился, например, при раке). Trinity остается одним из наиболее широко используемых инструментов в биоинформатике, имея почти 20 000 цитирований по состоянию на 2025 год.

С 2012 по 2018 год была постдокторантом в Институте Броуда при Массачусетском технологическом институте и Гарвардской медицинской школе, работая в лабораториях Эрика Ландера и Ксавье Ремника. В это время она переключилась на изучение микробиома, используя вычислительные и геномные инструменты для изучения микробных популяций в кишечнике человека и их роли в здоровье и болезнях.

В 2018 году присоединилась к Еврейскому университету в Иерусалиме в качестве старшего преподавателя на медицинском факультете.

Основное направление работы — изучение состава микробиома кишечника младенца.

В мае 2026 года сообщается: исследователи Еврейского университета Иерусалима с коллегами предложили способ контроля активности воспалительных заболеваний кишечника без использования инвазивных процедур. Ученые показали, что человеческая ДНК в кале, которую прежде считали биологическим "шумом" и тщательно отфильтровывали при изучении микробиома, содержит ценную диагностическую информацию. Работа опубликована в журнале Microbiome. Воспалительными заболеваниями кишечника – болезнью Крона и язвенным колитом – страдают сегодня более 10 миллионов человек во всем мире. С 1990 по 2021 год глобальная распространенность выросла почти на 80%, причем если в развитых странах заболеваемость стабилизируется, то в Азии и Латинской Америке она стремительно нарастает – вслед за урбанизацией и вестернизацией питания. Сегодня пациенты вынуждены регулярно проходить колоноскопию для контроля воспаления, это довольно болезненная процедура. Новый подход предлагает альтернативу: анализ человеческой ДНК в кале позволяет определить клеточное происхождение этой ДНК. Ученые показали, что в кале пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника доминирует ДНК нейтрофилов – иммунных клеток, мигрирующих в кишечник при воспалении. Их уровень точно коррелирует с тяжестью заболевания и известными клиническими маркерами. Кроме того, ученые разработали новый показатель – соотношение нейтрофилов к эпителиальным клеткам, – который точнее разграничивает ремиссию и активную фазу болезни. Совместный анализ человеческой и микробной ДНК с применением методов машинного обучения позволил не только выявлять воспалительные заболевания кишечника, но и различать болезнь Крона и язвенный колит. Результаты подтверждены как у детей в Израиле, так и у взрослых пациентов в Нидерландах. "Наши данные показывают, что эта ДНК содержит важную, недооцененную информацию, отражая активность иммунной системы в реальном времени", – отметила соавтор работы профессор Моран Яссур.

Труды

• Yassour, Moran; Vatanen, Tommi; Siljander, Heli; Hämäläinen, Anu-Maaria; Härkönen, Taina; Ryhänen, Samppa J.; Franzosa, Eric A.; Vlamakis, Hera; Huttenhower, Curtis; Gevers, Dirk; Lander, Eric S. (2016-06-15). "Natural history of the infant gut microbiome and impact of antibiotic treatment on bacterial strain diversity and stability". Science Translational Medicine. 8 (343): 343ra81. doi:10.1126/scitranslmed.aad0917. PMC 5032909. PMID 27306663.
• Yassour, Moran; Jason, Eeva; Hogstrom, Larson J.; Arthur, Timothy D.; Tripathi, Surya; Siljander, Heli; Selvenius, Jenni; Oikarinen, Sami; Hyöty, Heikki; Virtanen, Suvi M.; Ilonen, Jorma (2018-07-11). "Strain-Level Analysis of Mother-to-Child Bacterial Transmission during the First Few Months of Life". Cell Host & Microbe (באנגלית). 24 (1): 146–154.e4. doi:10.1016/j.chom.2018.06.007. ISSN 1931-3128. PMC 6091882. PMID 30001517.
• Kijner, Sivan; Kolodny, Oren; Yassour, Moran (2022-08-01). "Human milk oligosaccharides and the infant gut microbiome from an eco-evolutionary perspective". Current Opinion in Microbiology. 68. doi:10.1016/j.mib.2022.102156. ISSN 1369-5274. PMID 35598464.
• Kijner, Sivan; Cher, Avital; Yassour, Moran (2022-03-18). "The Infant Gut Commensal Bacteroides dorei Presents a Generalized Transcriptional Response to Various Human Milk Oligosaccharides". Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (באנגלית). 12. doi:10.3389/fcimb.2022.854122. ISSN 2235-2988. PMC 8971754. PMID 35372092.
• Kijner, Sivan; Ennis, Dena; Shmorak, Shimrit; Florentin, Anat; Yassour, Moran (2024-01-02). "CRISPR-Cas-based identification of a sialylated human milk oligosaccharides utilization cluster in the infant gut commensal Bacteroides dorei". Nature Communications (באנגלית). 15 (1): 105. Bibcode:2024NatCo..15..105K. doi:10.1038/s41467-023-44437-y. ISSN 2041-1723. PMC 10761964. PMID 38167825.
• Ennis, Dena; Shmorak, Shimrit; Jantscher-Krenn, Evelyn; Yassour, Moran (2024-01-30). "Longitudinal quantification of Bifidobacterium longum subsp. infantis reveals late colonization in the infant gut independent of maternal milk HMO composition". Nature Communications (באנגלית). 15 (1): 894. Bibcode:2024NatCo..15..894E. doi:10.1038/s41467-024-45209-y. ISSN 2041-1723. PMC 10827747. PMID 38291346.
• Hall, Andrew Brantley; Yassour, Moran; Sauk, Jenny; Garner, Ashley; Jiang, Xiaofang; Arthur, Timothy; Lagoudas, Georgia K.; Vatanen, Tommi; Fornelos, Nadine; Wilson, Robin; Bertha, Madeline (2017-11-28). "A novel Ruminococcus gnavus clade enriched in inflammatory bowel disease patients". Genome Medicine. 9 (1): 103. doi:10.1186/s13073-017-0490-5. ISSN 1756-994X. PMC 5704459. PMID 29183332.